南科大目前的改革仍走在國內公辦院校的前列，但其未來的發展不能滿足于成為第二個北大、清華，而是要建成有自己辦學特色和個性的第一個南科大。
教育部正式批復建設南方科技大學后的首屆畢業生，今年畢業。他們被視為首批具有標志意義的南科大學生。168名學生中，有近百分之六十的學生選擇繼續深造，少部分選擇了就業。
這所在中國改革開放“窗口”深圳全新打造的公立大學，自2007年籌建起的每一步，都得到了社會各界的不同期待和關切。一位南方科技大學的老師說，2012級畢業生們的選擇方向，也會成為這所大學改革成功與否的一個標志。
但在筆者看來，評價南科大的改革是否成功，關鍵要看對南科大的定位與期待。
如果將南科大定位為在中國探索“自主招生、自授學位”，以及“去行政化，去官僚化”的先行者，那其改革確實已經無疾而終。但如果站在體制內學校 改革角度審視，南科大目前的改革，應該說，還走在國內公辦院校的前列，包括三位一體的招生，實行小班化全英文教學等。但能否繼續堅持改革的勢頭，這取決于 南科大的辦學者，更考驗政府教育管理部門及南科大舉辦者放權推進改革的誠意。
南科大“自主辦學，自授學位”以及“去官僚化，去行政化”的改革，在2012年全面受阻。這被輿論解讀為步子邁得太大，把改革想得太簡單，因為 這是需要政府部門放權，但政府部門并沒有做好放這么大權的準備——擔心學校不能用好自主權。其實，政府部門的擔憂，對于建設小而精、研究型學校的南科大來 說，大可不必。政府部門完全可讓南科大大膽一試。如果成功，可為我國教改探索出新路；即便不成功，也可相機調整。
現在，毋庸置疑，南科大已經被逐漸納入傳統辦學體制，但即便如此，南科大還是被寄予改革厚望。那么，現在南科大的改革還會有哪些可作為呢？
首先是能否通過立法程序制定南科大章程。這是南科大必須解決的問題。
通過立法程序制定南科大章程，把南科大納入依法治校框架，這是朱清時擔任創校校長的最大愿望，可直到其卸任，也未能實現。至于南科大辦學者和深 圳市政府，已都不再提及。對于一所致力于建設現代大學制度的大學來說，這無疑讓關心南科大改革者極為困惑，沒有大學章程做依法治校的保障，拿什么來確保南 科大的改革不受人事變化，尤其是校長人選的變化而受到影響。據報道，2014年9月至2015年1月，南方科技大學中間有近半年的時間沒有校長，學生們 稱，“那是最迷惘的一段時間，覺得整個學校像是沒了靈魂。”
其次，南科大未來的路怎么走，不能只由校長說了算，必須廣泛聽取教授和學生的意見，充分論證。
南科大一份規劃顯示，目前南科大擁有12個系科17個理工專業，未來還將建設醫學院、商學院、人文社科學院和創業創新學院等院系。而在朱清時任 校長的2013年，南科大只擁有5個系6個專業。按照這份規劃，南科大已改變了小而精的辦學定位，在走高大全的綜合性大學辦學路線。那為何南科大會改變原 來的定位，而這樣的南科大，除了達到985高校中游水平外，對我國教育改革能起到多大推動作用呢？
南科大未來的發展，不能滿足于建設成第二個北大或清華，而是要建成第一個南科大，一個有自己辦學特色和個性的大學。這是南科大舉辦者和辦學者必須努力去探索求解的課題。這樣的南科大，才會在中國高等教育改革史上留下濃墨重彩的一筆。
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